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如果发现自己的苹果手机的短信消失了，可以尝试以下几种方法来恢复。
使用iCloud备份恢复
1、确保手机已登录Apple ID并开启了iCloud功能。
2、在设置中找到“通用”选项并点击“还原”。
3、选择“从iCloud备份恢复”。
4、选择最近的备份时间进行恢复，完成以上步骤后，短信可能会重新出现，但请注意，此方法会覆盖手机上的所有数据，所以操作前请确保备份时间距离当前数据丢失的时间较近。
方法二：使用iTunes备份恢复
如果已经使用iTunes备份过手机数据，可以通过以下步骤来恢复消失的短信：
1、将手机连接到电脑并打开iTunes。
2、选择设备并点击“恢复备份”。
3、选择最近的备份文件进行恢复，完成这些步骤后，短信也可能被恢复，同样，此方法也会覆盖手机上的所有数据，所以请确保选择正确的备份文件。
方法三：使用第三方软件恢复
如果没有使用iCloud或iTunes备份，可以尝试使用第三方软件来恢复消失的短信，可以使用易我手机数据恢复软件来扫描和恢复手机中的数据，这种方法相对较为灵活，但请确保选择可信赖的软件进行操作。
无论选择哪种方法，恢复前请确保备份数据的完整性并谨慎操作，以免造成更多数据损失，如果以上方法均无法恢复消失的短信，建议咨询苹果官方客服寻求更多帮助。